Il-kontribwenti jistgħu jiddiżattivaw in-numru tal-VAT tagħhom fi kwalunkwe ħin. Id-diżattivazzjoni tista’ tirriżulta minn għadd ta’ raġunijiet, inkluż il-waqfien tal-attività tan-negozju, in-nuqqas ta’ negozju jew fuq talba mill-Kummissarju għad-Dħul. Sabiex applikazzjoni għal dereġistrazzjoni tiġi pproċessata, persuna rreġistrata tal-VAT hija meħtieġa tieħu ħsieb il-kwistjonijiet pendenti kollha mal-Uffiċċju tal-Kummissarju għad-Dħul u ma jkollha l-ebda bilanċ tal-VAT dovut. L-attivazzjoni mill-ġdid tan-numri tal-VAT hija possibbli wkoll mal-applikazzjoni. Peress li n-numri tal-VAT huma uniċi għall-kontribwenti, ladarba kontribwent ifittex li jerġa’ jattiva r-reġistrazzjoni tal-VAT tiegħu, huwa jiġi pprovdut bl-istess numru tal-VAT li kellu qabel.

Diżattivazzjoni 

Kummerċjanti Waħdiena li għandhom Karta tal-Identità Maltija jew Karta ta’ Residenza Maltija li jitolbu biex in-numru tal-VAT jiġi diżattivat għandhom jużaw il-buttuna tal-login tas-Servizzi Personali

Utenti Delegati tal-VAT jew Prattikanti tat-Taxxa li jitolbu li n-numru tal-VAT jiġi diżattivat

Utenti Delegati tal-VAT jew Prattikanti tat-Taxxa li jitolbu li n-numru tal-VAT u n-numru tal-PE jiġu diżattivati f’isem persuni oħra għandhom jużaw il-buttuna tal-login tas-Servizzi Assenjati jew Delegati​